Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfascQ810U3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NfascQ810U3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms