Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TnnQ80Z71 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TnnQ80Z71 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms