Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttc28Q80XJ3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttc28Q80XJ3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttc28Q80XJ3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttc28Q80XJ3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttc28Q80XJ3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Ttc28Q80XJ3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc28Q80XJ3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ttc28Q80XJ3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ttc28Q80XJ3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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