Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Npm2Q80W85 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Npm2Q80W85 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms