Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pcsk9Q80W65 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms