Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AknaQ80VW7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AknaQ80VW7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms