Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms