Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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