Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms