Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NischQ80TM9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NischQ80TM9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
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