Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf8Q80TJ7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms