Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnfsf18Q7TS55 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms