Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LnpkQ7TQ95 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LnpkQ7TQ95 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms