Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prrc2bQ7TPM1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms