Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SugctQ7TNE1 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SugctQ7TNE1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SugctQ7TNE1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms