Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sox11Q7M6Y2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms