Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ScocQ78YZ6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms