Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Sys1Q78S06 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sys1Q78S06 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Sys1Q78S06 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Sys1Q78S06 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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