Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Smim12Q78RX3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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