Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cspg5Q71M36 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cspg5Q71M36 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms