Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ube2r2Q6ZWZ2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2r2Q6ZWZ2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms