Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SpopQ6ZWS8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms