Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncapd3Q6ZQK0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncapd3Q6ZQK0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms