Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms