Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cnot1Q6ZQ08 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cnot1Q6ZQ08 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms