Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssxb3Q6XAS4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms