Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc88cQ6VGS5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms