Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad54bQ6PFE3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms