Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup98Q6PFD9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nup98Q6PFD9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms