Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdgfrlQ6PE55 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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