Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sarm1Q6PDS3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sarm1Q6PDS3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms