Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SvoplQ6PDF3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SvoplQ6PDF3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms