Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Mfsd13aQ6PDE8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mfsd13aQ6PDE8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms