Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rexo4Q6PAQ4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rexo4Q6PAQ4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms