Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
BC061212Q6P8K3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
BC061212Q6P8K3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms