Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms