Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Soga3Q6NZL0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Soga3Q6NZL0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms