Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HelbQ6NVF4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HelbQ6NVF4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms