Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Amer3Q6NS69 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms