Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh1Q6IUP1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms