Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ParpbpQ6IRT3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ParpbpQ6IRT3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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