Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt40Q6IFX3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt40Q6IFX3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms