Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KdsrQ6GV12 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms