Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Smarca2Q6DIC0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Smarca2Q6DIC0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms