Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp7Q6A4J8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp7Q6A4J8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp7Q6A4J8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp7Q6A4J8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp7Q6A4J8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp7Q6A4J8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp7Q6A4J8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp7Q6A4J8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp7Q6A4J8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp7Q6A4J8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 955.5 ms