Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cep290Q6A078 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cep290Q6A078 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cep290Q6A078 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cep290Q6A078 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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