Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg9aQ68FE2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms