Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kiaa1549Q68FD9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kiaa1549Q68FD9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms