Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fnip1Q68FD7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fnip1Q68FD7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms