Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ino80dQ66JY2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ino80dQ66JY2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms